Na této trati se v minulosti udály další dvě srážky vlaků.
První z nich se udála 22. 7. 2004 mezi Bavorovem a Strunkovicemi nad Blanicí. Tehdy se srazily dva osobní vlaky Os
18008 (Volary - Číčenice) a Os 18035 (Číčenice - Volary). Při nehodě byly dvě osoby usmrceny a 33 jich bylo zraněno.
Škoda byla vyčíslena na 3 900 000. Příčinou této nehody bylo selhání strojvedoucího osobního vlaku Os 18008, který
nedovoleně odjel ze stanice Bavorov.
Dne 1. září 2007 v 08:10 hodin došlo mezi stanicemi Vodňany a Bavorov ke srážce vlaků osobní dopravy Os 18003 (Volary
- Číčenice) a Os 18032 (Číčenice - Volary). Celkem bylo zraněno dvanáct cestujících a jeden zaměstnanec dopravce.
Celková hmotná škoda na drážních vozidlech byla vyčíslena na 137 145,- Kč. Příčinou mimořádné události byl nedovolený
odjezd vlaku Os 18003 z Bavorova.
Srážka vlaků u Vodňan
Dnes v 8.14 hodin se mezi stanicemi Vodňany a Číčenice srazil osobní vlak Os 18003 (Volary – Číčenice) s nákladním vlakem. Dle informací Drážní inspekce byla na místě usmrcena jedna žena a dalších dvanáct lidí bylo zraněno. Pravděpodobnou příčinou nehody je selhání lidského činitele. Přesné určení příčin a okolností vzniku nehody bude známo po ukončení vyšetřování. Škoda byla odhadnuta na 5 260 000 Kč (5 mil. Kč osobní vlak, 250 tis. Kč nákladní vlak, 10 tis. Kč trať).